木ノ葉か隠れの里、忍術学校問題児だったナルトはサスケ、サクラとともに晴れて忍者の仲間入りを果たした。
中忍選抜試験に臨んだナルトたちは「死の森」で大蛇丸の急襲をうける。大蛇丸はサスケの身体に呪印を残してすがたを消した…。
ナルトとサスケは第三の試験の予選を勝ち抜き本選に進む。そして大観衆が見守る中、サスケ・蛾愛羅戦が始まった。その時、風影に化けた大蛇丸は火影を捕え結界を張る。遂に大蛇丸たちの木ノ葉崩しが始まった。一方、ナルトたちは姿を消したサスケと我愛羅を追う。だが一足遅く我愛羅は世にも恐ろしい姿に変貌しつつあった…。
