マインクラフトの世界にあるのどかな町、コーヌコピア。ここは巨大な壁で外の敵から守られ、人々は豊かな食べ物に恵まれ、心地よい家に住んでいる。だが、マル、レナ、チャグ、トックの４人組は「いい子」でいるルールになじめず、「腐ったリンゴ」と呼ばれていた。 ある日、壁の向こうから攻撃が始まり、それに気づいた４人は現実を受け入れられない町のおとなを頼らず、古くからのルールを破って壁の向こうのオーバーワールドへと旅立つ。 はるか遠くの森の洋館へ行き、敵を倒し、自分たちが腐ったリンゴではないととを証明するため、人々が失った知恵と勇気とクラフトの力を使い、はみだし探検隊の冒険が始まった！

さらわれた友だちをとり返せ! 新たな仲間を加えた「はみだし探検隊」は、人さらいを追って恐怖の世界ネザーで大冒険! 友情で困難を乗り越える、「はみだし探検隊」冒険シリーズ第2弾! 〈あらすじ〉 仲よし４人組『はみだし探検隊』の活躍で、コーヌコーピアの町は壁を開放し、外の世界とつながりを持つようになった。 だがそれは、オーバーワールドに住む悪い人間が、町に入り込むきっかけにもなったのだ…。 ある朝、『はみだし探検隊』のトックがなに者かに誘拐されてしまい、マル、チャグ、レナの三人は、ゆくえを追って再び外の世界へと出てゆく。 途中でいじめっ子のジャロを加え、マルたち一行は追跡の旅を続けるが、トックを連れ去っ男たちの目的地は、地獄のような別世界「ネザー」だった！ 失敗をしながらも成長するジャロの力を借りて、『はみだし探検隊』は仲間を取り返し、悪人たちのたくらみを打ち破れるのか。 友情で困難を乗り越える、勇気とクラフトの冒険ストーリー第２弾！