『スペル＆ライフズ』――魔法（スペル）と召喚獣（ライフ）をこの世に顕現させる異能のカード。17才の少年・桐谷駿（きりや しゅん）はそれらを操る力に覚醒したプレイヤーだ。全てのプレイヤーが集う人工島・色藤島（しきとうじま）にて、駿はある日、不正渡航者の少女・萌葱咲奈（もえぎ さな）と出会う。 非プレイヤーの咲奈は、この島で行方不明となった姉を追ってきたらしく――？ とある事情から咲奈に協力することとなった駿は、駿の恋人を自称する少女・ミラティアとカードを駆使して調査を開始。その人探しはしかし、異能の力に魅入られし存在の意志と思惑に繋がっていた。導かれるように、駿はカードを巡る戦いへと巻き込まれていき――。異能と頭脳、そして恋人。切り札は――その全てだ。